【院長室】central@mgst.org.tw
職掌：院務統籌、人事管理、推廣教育。
【教務處】acad@mgst.org.tw
職掌：註冊與學籍管理、成績登錄與管理、課務與課程安排、招生事務、學院行事曆。
【學務處】it@mgst.org.tw
職掌：崇拜事奉操練、導師時間服事協調。學院活動出席減免、請假申請。獎學金申請。
【總務處】gene@mgst.org.tw
職掌：教室與宿舍維護管理、設施與設備器材維修管理。
【出納組】cashier@mgst.org.tw
職掌：總機、財務與出納。
【資訊組】it@mgst.org.tw
職掌：學院資訊相關工作。
【衛理資料中心(圖書館)】library@mgst.org.tw
職掌：衛斯理特藏中心、圖書管理、借閱管理。
【推廣教育】central@mgst.org.tw
職掌：信徒神學教育課程規劃、招生與宣傳、課務與行政。